Vía aérea
Iquitos - Pucallpa:
Star Perú (1 diario)
Iquitos - Lima:
Lan (3 ó 4 vuelos diarios)
Star Perú (3 vuelos diarios)
ATSA (vuelos charter)
LC Busre (vuelos charter)
Iquitos - Tarapoto:
Star Perú (1 diario)
Pucallpa - Lima:
Lan (2 vuelos diarios)
Atsa (vuelos charter)
LC Busre (vuelos charter)
Vía terrestre
Se puede acceder desde Lima hasta Yurimaguas pasando primero por Tarapoto. Por la parte oriental se puede utilizar la carretera que une El Estrecho (frontera con Colombia) con Iquitos. Están en proyecto otras carreteras departamentales como la que une Borja Saramiza y Monje (extremo noroccidental del departamento) con Puerto Güepí (frontera con Ecuador y Colombia). Por ello, será necesario empalmar con transporte fluvial.
Lima - Tarapoto (22 horas): Civa, Cial, Movil Tours, Expreso Huamanga
Tarapoto - Yurimaguas (3 horas): Tarapoto -Yurimaguas: Expreso Huamanga, Paradise Estrella
Para Pucallpa, sí hay ruta directa desde la capital.
Lima - La Oroya - Cerro de Pasco - Huánuco - Tingo María - Pucallpa (18 horas): Transmar, León de Huánuco, Trans Rey
Vía fluvial
Yurimaguas - Iquitos:
A través de los ríos Huallaga y Marañón, con escala en el puerto de Nauta; la duración del viaje es de 12 a 15 horas en deslizador y tres a cuatro días en motonave.
Pucallpa - Iquitos:
Desde Puerto La Hoyada, Pucallpa, en un viaje que puede durar de uno a dos días en lancha y cuatro o cinco en motonave, dependiendo del nivel del río.
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